Mise en forme pour PAPA/PASOS

Convertit une matrice en disposition FLOCK vers le format à allèles collés (PAPA, PASOS, Doublons)

1 La matrice FLOCK de départ

Coller la matrice, ou ouvrir un fichier

Disposition FLOCK : première ligne l'en-tête (identifiant puis le nom de chaque locus), ensuite un individu par ligne avec deux colonnes par locus (un allèle chacune). Formats : .xls, .xlsx, .csv.

2 Le réglage

Code des données manquantes en sortie

Les allèles sont écrits sur 3 chiffres (un allèle inférieur à 100 reçoit un zéro devant, ex. 097) et rangés en ordre croissant, puis collés — un locus diploïde devient 6 chiffres (143163). Un locus manquant reçoit le code ci-dessus.